故事講述了主人公匡平離開(kāi)了自己的故鄉(xiāng)來(lái)到東京開(kāi)始了，過(guò)著平凡的大學(xué)生活。有一天夜里打算跟同班同學(xué)的日日乃告白，兩人卻意外目擊到了被斬殺的尸體。匡平有個(gè)妹妹叫詩(shī)緒，她有著“只”的資格可以操控被侍奉為“神的空殼”的神秘人偶“案山子”。她轉(zhuǎn)達(dá)了他關(guān)于他兒時(shí)玩伴阿幾逃出村子的消息。其實(shí)同樣是“只”的阿幾曾在村中引起過(guò)悲劇。后來(lái)他們?cè)獾搅税椎囊u擊……諸神的戰(zhàn)斗即將展開(kāi)……