傾注于天文研究的兜甲兒自海外歸國，為此而來到宇宙科學研究所參與見習，并且結識茂才特立的所長之子宇門大介。伴隨著曾出不窮的不明飛行物體出現，月亮在夜晚中產生被染成紅色的異象，存心積慮征服統治宇宙的‘貝嘉星連合軍’，開始要將魔爪伸往地球再掀新的戰端，以月球背面作為據點舉軍‘飛碟獸’侵略。有著一段不為人知的慘痛過去的大介，為了不讓所熱愛的第二故鄉重蹈覆轍，毅然地再度挺身而出駕駛古連泰沙恢復“狄克·弗利特”之名誓死賭上自身性命，與甲兒一同保護這片綠意盎然的大地。