1999年，一艘神秘的外星宇宙戰艦墜落地球，人們花了10年時間將之修復并命名為“MACROSS”。 可是，舉行起航典禮的當天，月球軌道附近突然出現超太空重疊反應，而MACROSS的主炮竟自動發射，擊中杰特拉蒂帝國的偵察艦，第一次宇宙戰爭由此爆發。MACROSS要塞想利用空間跳躍擺脫敵人，可是由于系統故障跳躍到冥王星軌道。 公元2009年，土星軌道上，MACROSS要塞緩緩的向地球行進。要塞內部正在……